A víz mikroszkóppal való vizsgálata elavult módszer. A vízben található organizmusok ismerete nagyon fontos különösen a felszíni vizeknél, mint a tengervíz, brakkvíz (félsós víz), édesvíz; továbbá az ivóvízben is. A vízben található mikroszkopikus élőlények ismeretében meghatározható az ökológiai minőség és állapot. Minél változatosabb a fitoplankton vagy zoo plankton összetétel, annál egészségesebb a vízminőség a kérdéses feszíni vízben. Az ember általi vízszennyezés eutrofizációt eredményez, amely során tápanyag dúsul fel a vízben és a fito planktonok elszaporodnak. Egyre több alga virágzás következik be világszerte, amikor csak egy kevés vagy egy-két főbb taxon hatalmas biomasszát okoz, főleg toxin termelte kék-zöld alga (cyanobaktérium) vagy dynoflagellates. A felszíni vizet ilyen minőségben képtelenség ivóvízként való vízforrásra vagy rekreációra, úgy mint fürdésre, úszásra vagy halastónak használni, egészséges hal-hús tenyésztésre. Jelenleg a vízminőség fizikai és kémiai paramétereinek mérése folyamatosan, on-line történik, azonban a víz biológiai összetételének meghatározása manuálisan meghatározható, időigényes változatban, mint a mikroszkopikus módszer. A WaterScope a mikroszkopikus folyamatot automatikussá teszi, képeket készít a plankton organizmusokról, automatikusan osztályozza és számolja őket. Lehetővé teszi korai figyelmeztető jelek küldését abban az esetben, ha toxikus mikroorganizmusok megjelenésére lehet számítani a vízben.